A industria pesqueira é responsavel pela produção de 196 milhões de toneladas de peixe e conseuqente geração de resíduos (pele, vísceras, ossos, escamas, cabeças, nadadeiras e etc) que geralmente são descartados ou transformados em produtos de baixo valor de mercado, como farinha de peixe, óleo de peixe, ração animal ou fertilizante. Esses subprodutos, ou resíduos, constituem até cerca de 50% do peso total da matéria-prima e são potenciais fontes de aminoácidos essenciais, colágeno, gelatina, lipídios poliinsaturados e enzimas, como as proteases pepsina, tripsina, quimotripsina e colagenases. Nos últimos anos o interesse por proteínas marinhas para produção de peptídeos de colágeno tem aumentado, devido à sua bioatividade, biocompatibilidade, alta biodisponibilidade e segurança. Com isso, a recuperação desses compostos é de grande interesse para diferentes industrias como a farmacêutica, alimentícia e nutracêutica. Desta forma, este trabalho objetivou produzir peptídeos bioativos de colágeno extraídos da pele de peixes Neotropicais para possíveis aplicações biotecnológicas e uma revisão sobre o assunto. Várias técnicas de recuperação, identificação e purificação de enzimas capazes clivar as ligações peptídicas das moléculas de colágeno e subsequentemente degrada-las em pequenos peptídeos a partir desses resíduos, tem sido utilizadas, como a técnica de semipurificação por sistema de duas fases aquosa (SDFA) que foi aplicada nos resíduo (vísceras) negligenciados da Tainha (Mugil liza) para tratamento de enzimas com atividade colagenolíticas. No sistema de duas fases aquosa PEG/citrato, de acordo com o planejamento fatorial 23, utilizando as variáveis Coeficiente de partição (K), Rendimento (Y), e Fator de purificação (FP) foi possível observar que os rendimentos da extração (Y) obtidos variaram de 89 a 124,34% e de 242,11 a 435,61% para protease e proteases com atividade colagenolítica, respectivamente. Os resultados mostraram a vantagem desta técnica de semipurificação no que se refere a extração e purificaçãode de enzimas colagenolíticas com aplicação industrial para produção de peptídeos de colágeno.