ESTABELECIMENTO DE UM PROTOCOLO ANÁLISES DE METAVIROMA A PARTIR DE AMOSTRAS DERIVADAS DE MOSQUITOS E CULTURAS CELULARES.
NGS, mosquitos vetores, DENV, Flaviviridae, Togaviridae e Parvoviridae
Os vírus identificados em mosquitos são subdivididos em dois grupos: os arbovírus, transmitidos a vertebrados e capazes de realizar replicação em ambos os vetores e hospedeiros e os vírus específicos de insetos (ISVs), que apresentam capacidade de replicação restrita ao hospedeiro invertebrado. Os descritos ISVs apresentam capacidade de modular respostas e efeitos contra arbovírus quando em coinfecção nos mosquitos, logo, a prospecção desses ISVs torna-se importante para análises de possíveis interferências em estudos de arbovirologia. Na última década, o uso de ferramentas da metagenômica na vigilância de arbovírus de importância médica tem se mostrado eficiente na descoberta de novos ISVs, devido a sensibilidade e alto rendimento das técnicas empregadas no sequenciamento de nova geração (NGS). Sendo assim, o objetivo deste trabalho de dissertação foi estabelecer um protocolo funcional para detecção de ISVs em mosquitos e células (C6/36), de linhagens de laboratório, bem como realizar a identificação de ISVs nos respectivos grupos por NGS. Foram testados dois métodos para detecção de vírus: por meio de PCR convencional com o uso de primers degenerados para flavivírus e alfavírus, em amostras de Cx. quinquefasciatus e Ae. aegypti e sequenciamento de nova geração, incluindo amostras de mosquitos e células C6/36. Não foi possível detectar ISVs por meio da técnica de PCR convencional. Com a análise de metaviroma por NGS foram identificados os vírus: Culex bunyavírus e Wutai mosquito phasivirus em amostras de Cx. quinquefasciatus e Culex densovirus em três das quatro amostras de sobrenadante de células C6/36 em coinfecção com os sorotipos de dengue 1, 2 e 3. Culex densovirus teve cobertura de 100% do genoma com profundidade de 21872 x. Os resultados deste trabalho trazem um protocolo de metaviroma eficiente na detecção de ISVs e arbovírus, além de reforçar a necessidade de analises prévias de metaviroma em estudos de arbovirologia.